Η Αρχή θεσπίζει δικούς της κανόνες ασφαλείας που είναι ισοδύναμοι με τους κανόνες ασφαλείας της Επιτροπής για την προστασία των διαβαθμισμένων πληροφοριών της Ευρωπαϊκής Ένωσης (ΔΠΕΕ) και των ευαίσθητων μη διαβαθμισμένων πληροφοριών, όπως καθορίζονται στην απόφαση (ΕΕ, Ευρατόμ) 2015/443 (
19
) και στην απόφαση (ΕΕ, Ευρατόμ) 2015/444 της Επιτροπής. Οι κανόνες ασφαλείας της Αρχής καλύπτουν, μεταξύ άλλων, τις διατάξεις σχετικά με την ανταλλαγή, την επεξεργασία και την αποθήκευση των εν λόγω πληροφοριών. Το εκτελεστικό συμβούλιο θεσπίζει τους κανόνες ασφαλείας της Αρχής, κατόπιν έγκρισης της Επιτροπής.