3. Jäsenvaltiot voivat vapauttaa tietyt reitit ja satamat 1 kohdan a ja b alakohdan soveltamisesta, kun on kyse energiasta, jota käytetään muiden matkustaja-alusten kuin risteilymatkustaja-alusten liikennöimillä matkoilla jäsenvaltion lainkäyttövaltaan kuuluvan käyntisataman ja saman jäsenvaltion lainkäyttövaltaan kuuluvan sellaisen käyntisataman välillä, joka sijaitsee saarella, jossa on alle 200 000 vakinaista asukasta, ja energiasta, jota käytetään mainittujen alusten ollessa kyseisen saaren käyntisatamassa. Tällaisia vapautuksia ei sovelleta 31 päivän joulukuuta 2029 jälkeen. Jäsenvaltioiden on ilmoitettava kyseisistä vapautuksista komissiolle ennen niiden voimaantuloa. Komissio julkaisee kyseiset vapautukset Euroopan unionin virallisessa lehdessä.