3. Med forbehold af stk. 1 skal de nationale tilsynsmyndigheder være uafhængige af enhver luftfartstjenesteudøver med hensyn til organisation, hierarki og beslutningstagning og være enten juridisk eller funktionelt adskilt fra luftfartstjenesteudøvere. Endvidere har luftfartstjenesteudøvere ingen beslutningskompetence med hensyn til fordelingen af de nationale tilsynsmyndigheders budgetter. Forudsat at en sådan uafhængighed garanteres, kan en national tilsynsmyndighed være underlagt samme nationale ministerium eller administration som en luftfartstjenesteudøver.