3. Με την επιφύλαξη της παραγράφου 1, οι εθνικές εποπτικές αρχές είναι ανεξάρτητες από τους φορείς παροχής υπηρεσιών αεροναυτιλίας από οργανωτική και ιεραρχική άποψη και από άποψη λήψης αποφάσεων, και είναι είτε νομικά είτε λειτουργικά διακριτές από τους φορείς παροχής υπηρεσιών αεροναυτιλίας. Επιπλέον, οι φορείς παροχής υπηρεσιών αεροναυτιλίας δεν έχουν εξουσία λήψης αποφάσεων σχετικά με την κατανομή του προϋπολογισμού των εθνικών εποπτικών αρχών. Με την προϋπόθεση ότι διασφαλίζεται η ανεξαρτησία αυτή, μια εθνική εποπτική αρχή μπορεί να αποτελεί μέρος του ίδιου εθνικού υπουργείου ή της ίδιας εθνικής διοίκησης ως ο φορέας παροχής υπηρεσιών αεροναυτιλίας.