2. Sertifiointijärjestelmien on toimittava riippumattomalla tavalla ja luotettavien ja läpinäkyvien sääntöjen ja menettelyjen perusteella, erityisesti kun on kyse sisäisestä hallinnoinnista ja seurannasta, kantelujen ja valitusten käsittelystä, sidosryhmien kuulemisesta, tietojen avoimuudesta ja julkistamisesta, sertifiointielinten nimeämisestä ja kouluttamisesta, vaatimustenvastaisuusongelmien ratkaisemisesta sekä sertifiointirekisterien kehittämisestä ja hallinnoinnista.
Sertifiointijärjestelmien on asetettava läpinäkyvät maksut ja huolehdittava siitä, että kyseisiä maksuja koskevat tiedot ovat helposti toiminnanharjoittajien saatavilla, myös julkaisemalla ne verkkosivustoillaan.
Sertifiointijärjestelmien on otettava käyttöön helposti saatavilla olevat kantelu- ja valitusmenettelyt. Tiedot kyseisistä menettelyistä on asetettava julkisesti saataville sertifiointirekisterissä tai, kun se on perustettu, unionin rekisterissä.